Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms