Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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