Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF1RP07333 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms