Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPBP07199 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms