Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB1P04280 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB1P04280 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRB1P04280 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB1P04280 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB1P04280 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRB1P04280 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRB1P04280 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms