Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTA1P02549 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms