Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPAN13O95857 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPAN13O95857 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms