Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA4FO95754 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms