Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPLO60437 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPLO60437 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPLO60437 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPLO60437 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPLO60437 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPLO60437 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPLO60437 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPLO60437 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms