Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCA5O60264 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMARCA5O60264 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms