Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLIN1O60240 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms