Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EFNA2O43921 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA2O43921 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms