Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIAH2O43255 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIAH2O43255 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms