Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CRXO43186 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRXO43186 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRXO43186 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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