Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNMO15061 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNMO15061 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNMO15061 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms