Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID1AO14497 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARID1AO14497 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms