Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms