Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QRK9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QRK9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QRK9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QRK9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms