Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3KRW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3KRW8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3KRW8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3KRW8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3KRW8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms