Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C6orf229H3BNL8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf229H3BNL8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms