Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NPIPB9F8W1W9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms