Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms