Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-1B6SEH8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVV-1B6SEH8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms