Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SMIM1B2RUZ4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMIM1B2RUZ4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms