Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISM1B1AKI9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ISM1B1AKI9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms