Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOBPA7XYQ1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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