Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS37CA5D8V6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS37CA5D8V6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms