Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms