Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U3KQ87 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQ87 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQ87 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQ87 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQ87 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQ87 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
U3KQ87 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U3KQ87 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
U3KQ87 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms