Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AUP1Q9Y679 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AUP1Q9Y679 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms