Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms