Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN16Q9Y5I7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms