Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF6Q9Y4K3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF6Q9Y4K3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms