Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLXND1Q9Y4D7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms