Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms