Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COG6Q9Y2V7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms