Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHDC2Q9Y2U9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms