Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR1DQ9Y2S0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms