Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC5Q9UQL6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms