Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCA2Q9UQC9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms