Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF24Q9UPV7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF24Q9UPV7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms