Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM35Q9UPQ4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms