Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNRF3Q9ULT6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms