Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms