Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNIKQ9UKE5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNIKQ9UKE5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms