Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MED13Q9UHV7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms