Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DBF4Q9UBU7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DBF4Q9UBU7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms