Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CCDC180Q9P1Z9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms