Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms