Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZDHHC3Q9NYG2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms